陳佩琪晚間透過臉書再發長文表示，醫生選擇執業地點會考慮什麼？ 第一當然是專業度的發揮，像自己有新生兒、小兒神經、小兒急診次專科的資格，自認研究不上手，所以選擇在聯醫工作；有些醫生則回歸基層診所，至少工時彈性大，收入也佳。
陳佩琪提及，昨天她說先生柯文哲建議他當選後，她去總統府醫務室當醫生，那裡算是基層醫療院所，沒PPF制只有公務人員薪水，找常駐醫生應該不容易，「先生認為要是他當選，或許我應該『做功德』，犧牲一下專業和薪水去那裏服務，沒想到這論點卻引來大批人撻伐，我要強調這職位要是有人想去，我絕對舉雙手贊成，不會跟人搶這個啦，只是很懷疑會有哪個醫師想去而已」。
陳佩琪說，今天除看到一堆民進黨人士抗議，說當醫務室醫師是分官封爵外，其實連她的病人也加入抗議行列，說自己要棄他們於不顧，但她要大家放心，「這些意見我都會收集起來，晚上先生回來轉交他參考，我會跟他說這麼多人反對，不要叫我去啦，這個家、我的病人還要靠我呢，在此也謝謝民進黨這些民代、名嘴、側翼對我這麼好，不忍我這麼優秀的醫生犧牲專業和薪水去那裡執業，謝謝你們解決了我的煩惱，不然我都不知道要如何跟先生說呢」。
陳佩琪表示，請支持者放心，她的專業、資歷和在病人間的口碑，不會找不到工作的，在任何地方當醫生，專業都好發揮，薪水也都比那裏高，小兒科醫師缺人，沒到法定退休年齡， 醫院也不會輕易放人。
話鋒一轉，陳佩琪酸說，大家會不會「做功德」這三個字耳熟能詳，長照員和基層護師辛苦低薪、職業傷害大，常不受尊重，行政院長在廟堂之上不思幫第一線人員解決問題，卻大喇喇地公然叫你們這些人「就當作是做功德」吧。
陳佩琪批，站在第一線犧牲奉獻的人，當然有權利自嘲自己是「做功德」，但最高行政機關的首長不思政策檢討改進，卻開口閉口只知道叫人「做功德」， 這就叫失職、無能，難怪行政院素有功德院的美譽。
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