世界盃帶起的棒球熱，幫助低迷的職棒環境逐漸回溫。根據日前播出的台灣演義報導，球評曾文誠在節目中指出「那個真的是當然國家英雄；2001年之後，我覺得台灣也產生了不少的棒球迷，直到現在，所以那個影響是蠻大的」。2003年中華職業棒球聯盟也與台灣職棒大聯盟在經過協議之後宣布合併，更名為中華職業棒球大聯盟。
這一次職棒好不容易回春，卻又接連爆發打假球簽賭案。2005年開始，五年當中出現四次檢調單位大規模調查和約談涉嫌打放水球的球員，甚至球團就有高層是黑道直接介入。前米迪亞暴龍球員周思齊說，「當時在米迪亞的時候，全部的管理組織、行政都是黑道，會有邀約要的飯局，會有壓力，因為他是球隊裡面的人，然後他邀約的飯局可能是高層，或者是老闆你要去，要想辦法跑開，比方說假裝打電話，後來就離開把手機關機，隔天他問的時候就裝死這樣子」直到2008年球季結束，米迪亞暴龍十多位球員以及多位管理人員因簽賭放水案遭起訴，中華職棒聯盟也將米迪亞除名。同年，屢因賭博案折損球員的中信鯨，因尋求和其他球隊合併不成，也宣布解散。
2009年中職爆發第五次簽賭案，老牌球隊兄弟象、LA NEW熊、興農牛和前中信鯨都有球員涉入，其中甚至包括總教練和旅外歸國球星，總數近七十人，規模是歷次之最。
接連爆發假球案徹底傷害台灣職業棒球，產業蕭條盪到谷底，發展停滯將進10年。中華職報痛定思痛，和檢警合作建立防賭機制，並實施自由球員制度，給球員更多薪資保障；加上2008年上路的運動彩券，讓球迷可以透過合法途徑簽注，導正博弈風氣，都收到效果。
2013年世界棒球經典賽，台灣隊從資格賽起取下五連勝，對戰日韓也打出精彩激戰，再一次帶動棒球熱，下一次中華職棒球季進場人數成長1.5倍。縱使假球案讓國人失望，但台灣人對棒球的愛始終不變，也期望球員能夠秉持初心比賽，別在令球迷失望。
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